Square Eyes er satt til en fremtid der grensene mellom minner, drømmer, og den digitale verden har fusjonert i en grøt der de er vanskelig å skille fra hverandre. De vakre, kaleidoskopiske tegningene presenterer en historie om en by bygd på en digital illusjon. Hvem har makten? Hva er svakhet? Og når begynner det å bli farlig?